改革开放30多年以来，既是新疆经济-社会发展最快的时期，也是新疆分裂与反分裂斗争严峻的时期。从内部的因素来看，多年来新疆发展与稳定的失衡成为分裂主义快速发展的主要驱动力之一。新疆发展与稳定的失衡主要表现在非均衡性的发展与横向差异的扩大上。一方面，经济层面的非均衡性发展，表现为新疆与内地之间地区差别、城乡差别、行业差别、群体差别的不断扩大；另一方面，社会层面上群体边界的不断清晰与强化。

一般来说，经济收入差距的拉大，并不必然导致群体特别是族群间的冲突，但是新疆的问题特殊性在于经济上的发展差距是落脚于族群上的，这一点加上族群间的边界乃至隔阂不断加大，导致族群间的矛盾与冲突并间接刺激了民族分裂主义的发展。如前文所述，新疆分裂主义的产生和发展是历史、文化、国际环境与外部势力、内部民族间的竞争与矛盾等一系列因素综合作用的结果。但是，不可否认的是，内部的民族经济-社会矛盾因素在改革开放以来表现得尤为明显。发展差距带来的矛盾和问题，常常被民族分裂势力夸大和利用，成为它们煽动民族仇恨、鼓吹民族分裂的口实。在内外敌对势力的刻意利用下，新疆与内地以及新疆内部的发展差距这一经济-社会问题逐渐政治化，成为民族分裂主义的驱动力之一。

需要指出的是，新疆发展与稳定的失调，并非刻意的制度安排的结果。包括汉族、维吾尔族等的各族人民均是民族冲突与分裂主义的受害者。改革开放以来的快速发展过程中公平与正义的缺失，既导致一系列差别的扩大，也造成民族群体间的隔阂、不满乃至冲突，间接刺激了新疆分裂主义的发展。总体而言，这种失调的根源在于少数民族群体参与发展及分享发展成果的不足，而民族群体间政治、经济和文化权益的差异问题造成的