纵观100年来新疆分裂主义产生和发展的历史可以发现，晚清以来，新疆分裂的危险主要来自两个方面：一方面，境外敌对势力妄图侵略蚕食新疆领土，将新疆的部分或全部领土从中国分裂出去，建立所谓的“独立缓冲国”，苏联在这方面曾起过很坏的作用；另一方面，新疆境内的民族分裂分子妄图否定中国中央政府在新疆的统治，建立所谓的“伊斯兰国家”或“突厥国家”，为此不惜与境外敌对势力相勾结，大力推动“东突”问题的国际化，给我们的反分裂斗争制造新的麻烦。而新疆内部民族关系的恶化、民族矛盾的累积和民族冲突的发生，往往导致新疆局势大乱，并进而为分裂分子和境外敌对势力趁机扰乱新疆提供可乘之机，“阿古柏乱疆”、“东突厥斯坦伊斯兰共和国”和“东突厥斯坦共和国”的出炉均与新疆内部的混乱有很大的关系，鉴于这些深刻的历史教训，治理新疆必须十分重视新疆内部民族关系的协调，而这一点曾经在很多年未能引起足够的重视。