大致从嘉靖年间开始，鄂尔多斯万户才在某种程度上独立与明朝进行接触。与土默特万户以寇边迫使明朝进行通贡互市不同，鄂尔多斯万户虽然频繁寇边，但并未伴随积极的求贡。隆庆和议后，鄂尔多斯万户与明朝的互市关系亦不稳定，这与鄂尔多斯万户游牧经济的特点密切相关。与此相应，明朝的政策并非只是一味地因应，而是积极主动地在修边、捣巢及互市之间腾转挪移，以实现其利益的最大化。